手术控制系统在俄罗斯注册的步骤包括：

1. 确定医疗器械的用途、类型和风险等级，并了解相关的法规和标准。

2. 准备申请材料，包括产品技术文档、质量管理体系文档、企业资质证明等。这些文件应详细描述手术控制系统的设计、性能、安全性等方面的信息，并证明产品符合俄罗斯的技术标准和法规要求。

3. 将申请材料提交给俄罗斯联邦卫生部或当地卫生部门进行审核和评估。这可能涉及在线提交或在建议的地点递交文件。

4. 俄罗斯联邦卫生部对申请材料进行审核，产品符合相关标准和要求。这可能包括技术性能测试、安全性评估等。

5. 如果产品通过审核，将安排样品测试。测试结果将作为申请注册的重要依据。

6. 准备完整的注册卷宗，包括测试结果和其他必要文件，提交给俄罗斯联邦进行审查。审查过程中可能需要额外的测试或文件补充。

7. 俄罗斯联邦对注册卷宗进行审查。如果一切符合要求，可能会批准设备的注册，并颁发相应的证书，允许产品在俄罗斯市场上销售和使用。

请注意，以上步骤可能因具体法规和政策的变化而有所不同。在进行注册前，建议咨询的医疗器械注册或律师，以符合较新的法规要求。