欧盟医疗器械认证办理需要进行体系审核。欧盟医疗器械指令要求制造商建立并维持一个质量管理体系，以确保医疗器械产品的安全性和有效性。体系审核的目的是评估企业的质量管理体系是否符合欧盟的相关法规和标准，以及是否在实际操作中得到有效执行。

在审核过程中，认证机构将对企业的质量管理体系进行全面的检查，包括文件审核、现场检查、产品抽检等方面。如果企业的质量管理体系存在缺陷或不符合相关法规和标准，认证机构将要求企业进行整改，并在规定时间内完成整改后重新进行审核。只有通过体系审核的企业，才能获得欧盟医疗器械认证，进而在欧盟市场上销售和使用其产品。

因此，对于想要进入欧盟市场的医疗器械制造商来说，建立完善的质量管理体系并通过体系审核是必不可少的步骤。建议企业选择有经验的第三方机构进行指导和协助，以确保顺利通过体系审核。